Muito boa essa dica, muito obrigado professor abrahao.
Todas as máquinas do laboratório da escola em que trabalho estão infectadas com um virus chato que cria atalhos em seu pendrive com o mesmo nome e icones dos arquivos existentes, e faz com que esses atalhos apontem para o virus. Ou seja, qualquer item do pendrive que você clicar vai infectar o pc.
Muitos alunos chegam a mim pedindo para limpar o pendrive deles. Vou então explicar o procedimento que uso:
Primeiro vá numa máquina que não esteja infectada, e no Windows Explorer mande exibir todos os arquivos. Você verá que os seus arquivos ainda estão no pendrive, porém com atributo OCULTO.
O primeiro passo é excluir todos os atalhos existentes.
Depois exclua pastas suspeitas, executáveis e o arquivo autorun.inf (se existir). Na figura abaixo eu apaguei tudo o que está marcado em azul e mais as duas pastas com as setas vermelhas.
Acesse o prompt de comando. Entre na unidade do seu pendrive (neste exemplo foi G:) e digite o comando mostrado abaixo:
attrib -r -s -a -h /s /d

Esse comando remove qualquer marcação de OCULTO que as pastas e arquivos tiverem.
Feito isso, crie uma PASTA chamada autorun.inf. Isso não vai evitar que o pendrive seja infectado novamente, porém não vai deixar o vírus se instalar num computador que esteja livre do vírus.
Depois de fazer os comandos acima, remova os atalhos com o comando a seguir:
del /f *.lnk
Agora remova o autorun.inf que é o arquivo que faz o virus ser executado automaticamente, com o comando a seguir:
del /f autorun.inf
Fonte: http://professor-abrahao.blogspot.com/2010/09/removendo-o-virus-que-cria-atalhos.html
DICA: O legal é instalar um programinha chamado PANDA USB VACCINE, clique aqui e baixe.